Titre : | Recherche syndromique des pathogènes respiratoires : Comparaison de 3 kits de PCR en temps réel | Type de document : | TFE | Auteurs : | Logan Woillard, Auteur | Editeur : | Angleur : HELMo Sainte-Julienne | Année de publication : | 2015 | Note générale : | Travail de fin d'études (TFE) -- Bachelier-Technologue de laboratoire médical -- HELMo Sainte-Julienne, Angleur, 2015 | Langues : | Français (fre) | Résumé : | Introduction : les infections aiguës des voies respiratoires sont les infections les plus répandues et les plus couramment rencontrées tout au long de l’année et particulièrement lors de la période hivernale. Elles représentent une cause de maladies relativement sévères chez les enfants, les personnes âgées ainsi que chez les patients immunodéprimés. Les médecins se retrouvent souvent en difficulté car les agents respiratoires provoquent fréquemment des pathologies présentant des symptômes semblables rendant ainsi les diagnostics compliqués.
Objectif : l’objectif de ce TFE est de comparer la sensibilité analytique et la spécificité de trois kits commerciaux dans le cadre du diagnostic des infections respiratoires. Le but final du travail est de comparer les techniques afin de savoir quelle est la méthode la plus efficace, la moins chère ainsi que la plus facile et la plus adaptée à l’utilisation.
Matériel utilisé : nous avons analysé le Kit FilmArrayTM Repiratory Panel (Biomérieux) réalisé sur le BioFire et les kits Resp’EasyTM (Diagenode) et RespiFinder® 2SMART (PathoFinder), tous deux réalisés sur le Light Cycler® 480 II avec extraction au préalable sur le NucliSENS® easyMag®. Nous avons utilisé un contrôle commercial Amplirun® (Vircell®). Ce panel est un mélange de 10 virus.
Résultats : la dilution 10 fois représente la sensibilité maximale pour les trois kits pour laquelle la détection qualitative est encore possible. Le kit BioFire FilmArrayTM RP a pu identifier la majeure partie des virus présents dans le panel. Le kit PathoFinder n’a détecté que quatre des virus présents dans le panel. Le kit Resp’EasyTM (Diagenode) identifie tous les virus présents dans le panel de la solution concentrée.
Discussion : Le kit Resp’EasyTM (Diagenode) est la méthode d’analyse la plus spécifique car tous les virus du panel Amplirun® (Vircell®) ont été détectés. On peut cependant lui reprocher d’être onéreux, difficile d’utilisation et de ne pas être utilisé pour des analyses d’urgences car il nécessite la présence d’un technicien qualifié en biologie moléculaire et l’utilisation de machines qui ne tournent pas 24h/24. Le kit BioFire FilmArrayTM Respiratory Panel est une technique d’analyse simple et rapide d’utilisation. Il peut être utilisé par du personnel non qualifié en biologie moléculaire. Cependant, elle représente une spécificité moindre par rapport au kit Resp’EasyTM (Diagenode). Le kit RespiFinder® 2SMART (PathoFinder) présente une mauvaise spécificité ; ne détectant à peine que la moitié des virus présents dans le panel Amplirun® (Vircell®). Son utilisation se révèle assez difficile d’utilisation, n’apportant pas de réels avantages au niveau pratique par rapport au kit Resp’EasyTM.
Conclusion : dans le cadre des analyses effectuées dans un laboratoire de routine en biologie moléculaire où l’on souhaite identifier des pathogènes responsables de maladies des voies respiratoires, il est conseillé d’utiliser le kit Resp’EasyTM (Diagenode) car c’est la méthode la plus sensible et la plus spécifique malgré le fait qu’il puisse être onéreux en cas d’analyses de plusieurs échantillons étant donné que la méthode consomme une barrette par échantillon. On pourra également employer le kit BioFire FilmArrayTM Respiratory Panel pour sa facilité d’utilisation. Les résultats négatifs obtenus avec le kit Resp’EasyTM devront être confirmés par une autre méthode.
Les infections aiguës des voies respiratoires sont les infections les plus répandues et les plus couramment rencontrées tout au long de l’année et particulièrement lors de la période hivernale. Elles représentent une cause de maladies relativement sévères chez les enfants, les personnes âgées ainsi que chez les patients immunodéprimés. Les médecins se retrouvent souvent en difficulté car les agents respiratoires provoquent fréquemment des pathologies présentant des symptômes semblables rendant ainsi les diagnostics compliqués.
L’objectif de ce TFE est de comparer la sensibilité analytique et la spécificité de trois kits commerciaux dans le cadre du diagnostic des infections respiratoires. Nous avons testé des dilutions successives d’un contrôle commercial Amplirun® (Vircell®). Ce panel est un mélange de 10 virus. Nous avons analysé ces dilutions au kit FilmArrayTM Respiratory Panel (Biomérieux) réalisé sur le BioFire et sur les kits Resp’EasyTM (Diagenode) et RespiFinder® 2Smart (PathoFinder), tous deux réalisés sur le Light Cycler® 480 II avec extraction au préalable sur l’easyMAG. Le but final du travail est de comparer les techniques afin de savoir quelle est la méthode la plus efficace, la moins chère ainsi que la plus facile et la plus adaptée à l’utilisation. |
Recherche syndromique des pathogènes respiratoires : Comparaison de 3 kits de PCR en temps réel [TFE] / Logan Woillard, Auteur . - Angleur : HELMo Sainte-Julienne, 2015. Travail de fin d'études (TFE) -- Bachelier-Technologue de laboratoire médical -- HELMo Sainte-Julienne, Angleur, 2015 Langues : Français ( fre) Résumé : | Introduction : les infections aiguës des voies respiratoires sont les infections les plus répandues et les plus couramment rencontrées tout au long de l’année et particulièrement lors de la période hivernale. Elles représentent une cause de maladies relativement sévères chez les enfants, les personnes âgées ainsi que chez les patients immunodéprimés. Les médecins se retrouvent souvent en difficulté car les agents respiratoires provoquent fréquemment des pathologies présentant des symptômes semblables rendant ainsi les diagnostics compliqués.
Objectif : l’objectif de ce TFE est de comparer la sensibilité analytique et la spécificité de trois kits commerciaux dans le cadre du diagnostic des infections respiratoires. Le but final du travail est de comparer les techniques afin de savoir quelle est la méthode la plus efficace, la moins chère ainsi que la plus facile et la plus adaptée à l’utilisation.
Matériel utilisé : nous avons analysé le Kit FilmArrayTM Repiratory Panel (Biomérieux) réalisé sur le BioFire et les kits Resp’EasyTM (Diagenode) et RespiFinder® 2SMART (PathoFinder), tous deux réalisés sur le Light Cycler® 480 II avec extraction au préalable sur le NucliSENS® easyMag®. Nous avons utilisé un contrôle commercial Amplirun® (Vircell®). Ce panel est un mélange de 10 virus.
Résultats : la dilution 10 fois représente la sensibilité maximale pour les trois kits pour laquelle la détection qualitative est encore possible. Le kit BioFire FilmArrayTM RP a pu identifier la majeure partie des virus présents dans le panel. Le kit PathoFinder n’a détecté que quatre des virus présents dans le panel. Le kit Resp’EasyTM (Diagenode) identifie tous les virus présents dans le panel de la solution concentrée.
Discussion : Le kit Resp’EasyTM (Diagenode) est la méthode d’analyse la plus spécifique car tous les virus du panel Amplirun® (Vircell®) ont été détectés. On peut cependant lui reprocher d’être onéreux, difficile d’utilisation et de ne pas être utilisé pour des analyses d’urgences car il nécessite la présence d’un technicien qualifié en biologie moléculaire et l’utilisation de machines qui ne tournent pas 24h/24. Le kit BioFire FilmArrayTM Respiratory Panel est une technique d’analyse simple et rapide d’utilisation. Il peut être utilisé par du personnel non qualifié en biologie moléculaire. Cependant, elle représente une spécificité moindre par rapport au kit Resp’EasyTM (Diagenode). Le kit RespiFinder® 2SMART (PathoFinder) présente une mauvaise spécificité ; ne détectant à peine que la moitié des virus présents dans le panel Amplirun® (Vircell®). Son utilisation se révèle assez difficile d’utilisation, n’apportant pas de réels avantages au niveau pratique par rapport au kit Resp’EasyTM.
Conclusion : dans le cadre des analyses effectuées dans un laboratoire de routine en biologie moléculaire où l’on souhaite identifier des pathogènes responsables de maladies des voies respiratoires, il est conseillé d’utiliser le kit Resp’EasyTM (Diagenode) car c’est la méthode la plus sensible et la plus spécifique malgré le fait qu’il puisse être onéreux en cas d’analyses de plusieurs échantillons étant donné que la méthode consomme une barrette par échantillon. On pourra également employer le kit BioFire FilmArrayTM Respiratory Panel pour sa facilité d’utilisation. Les résultats négatifs obtenus avec le kit Resp’EasyTM devront être confirmés par une autre méthode.
Les infections aiguës des voies respiratoires sont les infections les plus répandues et les plus couramment rencontrées tout au long de l’année et particulièrement lors de la période hivernale. Elles représentent une cause de maladies relativement sévères chez les enfants, les personnes âgées ainsi que chez les patients immunodéprimés. Les médecins se retrouvent souvent en difficulté car les agents respiratoires provoquent fréquemment des pathologies présentant des symptômes semblables rendant ainsi les diagnostics compliqués.
L’objectif de ce TFE est de comparer la sensibilité analytique et la spécificité de trois kits commerciaux dans le cadre du diagnostic des infections respiratoires. Nous avons testé des dilutions successives d’un contrôle commercial Amplirun® (Vircell®). Ce panel est un mélange de 10 virus. Nous avons analysé ces dilutions au kit FilmArrayTM Respiratory Panel (Biomérieux) réalisé sur le BioFire et sur les kits Resp’EasyTM (Diagenode) et RespiFinder® 2Smart (PathoFinder), tous deux réalisés sur le Light Cycler® 480 II avec extraction au préalable sur l’easyMAG. Le but final du travail est de comparer les techniques afin de savoir quelle est la méthode la plus efficace, la moins chère ainsi que la plus facile et la plus adaptée à l’utilisation. |
|